Prácticas - Guillermo Cerrillo

Prácticas Curriculares cursadas en en el Laboratorio de Modestro Redrejo Rodríguez (Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, Universidad Autónoma de Madrid), febrero - abril de 2024.

El área de estudio de este laboratorio son las pipolinas, una familia de elementos genéticos móviles que, gracias a su capacidad para sintetizar su propia ADN polimerasa B, son capaces de auto-replicarse.

El enfoque de mis prácticas ha sido, en su totalidad, bioinformático y con la finalidad de afianzar mis habilidades con lenguajes de programación como Python y R y otras herramientas informáticas como GitHub.

Préviamente, habían sido descargados todos los genomas bacterianos disponibles en GeneBank a fecha de noviembre de 2022 y fueron analizados en busca de pipolinas. Dicho experimento arrojó como resultado una lista de aproximadamente 12.000 genomas con pipolinas, que fueron la base de datos para todas las actividades que llevé a cabo durante mi estancia.

Me encargué de analizar estos genomas con diversas herramientas en busca de distintos elementos como genes de virulencia, genes de resistencia, integrones y orígenes de replicación; así como de representar gráficamente los resultados en función de su taxonomía.

En esta prágina encontrarán el procedimiento que llevé a cabo y los resultados obtenidos.